Sci Rep:5-miRNA标签特征可作为气管鳞状细胞癌的预后生物标志物

2022-02-14 11:50:26 来源:
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这项研究旨在相符一种可以预测冠状动脉鳞状巨噬细胞癌(ESCC)患者相比较致死率(OS)的miRNAs页面。

从NCBI GEO拿到119名ESCC患者的miRNA表达出来磬及其其所的临床资讯,并将其作为训练集。在早期和后期抽取间检验差异表达出来的miRNAs(DEmiRNAs)。用到Cox回归研究、递归特征消除(RFE)-支持矩阵机(SVM)搜索算法和LASSO Cox回归框架来比对病状开放性miRNAs,从而建起病状评价框架。此外,预测了这些病状开放性miRNAs的有前途靶突变,然后紧密结合了miRNA靶突变网络。通过机制富集研究,研究了ESCC中都这些病状开放性miRNAs预测靶突变的机制相关开放性。

在训练集中都,早期与后期抽取有46个DEmiRNAs。建起了基于5个miRNAs的风险评价框架。该5-miRNA风险评价可以将训练集分为OS短时间微小有所不同的高危组和低危组。在一个来自癌症突变组图解(TCGA)的独立数据集中都,成功验证了5-miRNA风险评价的风险低层能力。已相符了与这些miRNAs相关的各种药理学过程和闭环,例如Wnt瞬时闭环、TRP通道的炎症真空抑制闭环和雌二醇瞬时闭环。

这项研究提示,与病理分期相关的5-miRNA页面对预测ESCC患者的病状很强临床意义。

原始应是:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

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